Cómo investigar el error StackOverflow en Spark

Estoy dirigiendo un grupo de 15 trabajadores estándar de Dataproc. Mis datos I/O están en formato Avro.

La última etapa en el trabajo de chispa es guardar datos, que termina con StackOverflowError. El DAG es:

enter image description here

Y estadísticas de los trabajadores:

enter image description here

El registro con el error:

java.lang.StackOverflowError
at java.io.ObjectInputStream$BlockDataInputStream.peekByte(ObjectInputStream.java:3076)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1618)
at java.io.ObjectInputStream.defaultReadFields(ObjectInputStream.java:2405)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:2329)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2187)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1667)
at java.io.ObjectInputStream.readArray(ObjectInputStream.java:2093)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1655)
at java.io.ObjectInputStream.defaultReadFields(ObjectInputStream.java:2405)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:2329)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2187)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1667)
at java.io.ObjectInputStream.defaultReadFields(ObjectInputStream.java:2405)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:2329)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2187)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1667)
at java.io.ObjectInputStream.defaultReadFields(ObjectInputStream.java:2405)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:2329)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2187)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1667)
at java.io.ObjectInputStream.defaultReadFields(ObjectInputStream.java:2405)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:2329)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2187)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1667)

Intenté:

  1. investigue el monitoreo de casos VM de trabajadores fallidos (todo está bien)

  2. tamaño de la partición del equilibrio (reduciendo da el mismo error de flujo de pila)

  3. tune chispa.ejecutor.memoryOverhead, chispa.serializer, etc.

Nada parece funcionar hasta ahora. Las preguntas que quiero hacer son las siguientes:

  1. por qué iniciar sesión con puntos de error en java.io.ObjectInputStream$BlockDataInputStream.read Byte como la causa del error?

  2. ¿Cómo mejoro la política de investigación para temas como StackOverflow?

¡Gracias!

Pregunta hecha hace 3 años, 4 meses, 29 días - Por cyberscribe


2 Respuestas:

  • El error java.lang.StackOverflowError indica que la pila de llamadas del programa ha alcanzado su límite. En el caso que presentas, el error parece estar relacionado con la lectura de objetos en un ObjectInputStream.

    Para investigar este tipo de errores en Spark, puedes seguir los siguientes pasos:

    • Revisar el código: Analiza el código que está causando el error, en este caso, la lectura de objetos en un `ObjectInputStream`. Verifica si hay algún bucle infinito o una recursión mal implementada que pueda estar causando el desbordamiento de pila.
    • Revisar la configuración de Spark: Ya has intentado ajustar algunas configuraciones como `spark.executor.memoryOverhead` y `spark.serializer`, pero también puedes revisar otras configuraciones como `spark.driver.memory`, `spark.executor.memory`, y `spark.executor.cores`. Ajustar correctamente estas configuraciones puede ayudar a evitar errores de StackOverflow.
    • Revisar el DAG del trabajo Spark: Analiza el DAG del trabajo Spark para identificar si hay alguna operación o transformación que pueda estar causando un exceso en la profundidad de la llamada, lo que podría llevar a un StackOverflowError.
    • Revisar el tamaño de los datos: Si estás procesando grandes cantidades de datos, asegúrate de que el tamaño de los datos no esté contribuyendo al error. Podrías considerar ajustar la partición de los datos o modificar la estructura del DAG para optimizar el procesamiento.
    • Monitoreo y seguimiento continuo: Continúa monitoreando los registros y métricas de los trabajadores de Spark para identificar cualquier otro patrón o problema que pueda estar contribuyendo al error.

    En cuanto a tus preguntas específicas:

    • Puntos de error en `java.io.ObjectInputStream$BlockDataInputStream.readByte`: Este error específico en la lectura de bytes puede deberse a un problema en el proceso de deserialización de objetos en el `ObjectInputStream`. Podría estar relacionado con la forma en que se están leyendo los datos Avro o con la estructura de los datos mismos.
    • Mejora de la política de investigación para temas como StackOverflow: Para investigar de manera más efectiva problemas como el StackOverflow, es importante realizar una revisión exhaustiva del código, de las configuraciones de Spark, del DAG del trabajo, y del entorno de ejecución en general. Además, puedes considerar la implementación de pruebas unitarias y de integración para validar el funcionamiento de tu código y detectar posibles problemas antes de la ejecución en producción.

    Espero que estos consejos te sean de ayuda para investigar y resolver el error de StackOverflow en tu trabajo de Spark. ¡Déjame saber si tienes alguna otra pregunta!

    Respondida el Dec 18, 2020 a las 13:47 - por Gpt

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  • Respuestas a tus preguntas:

    1. ¿Por qué el error se produce en java.io.ObjectInputStream$BlockDataInputStream.readByte?

    El mensaje de error indica que el error se produce cuando la secuencia de entrada de objetos intenta leer un byte. Este error generalmente ocurre cuando hay un problema con la serialización o deserialización de objetos. En tu caso, es probable que el objeto que se está intentando deserializar sea demasiado grande o complejo, lo que provoca un desbordamiento de pila.

    2. ¿Cómo mejorar la política de investigación para problemas de StackOverflow?

    Para mejorar la política de investigación para problemas de StackOverflow, puedes seguir estos pasos:

    Identifica el punto de origen: Rastrea el origen del error utilizando una herramienta de depuración como Java VisualVM, que te permitirá inspeccionar la pila de llamadas y determinar dónde se produce el desbordamiento de pila. Analiza el objeto: Una vez que hayas identificado el origen del error, examina el objeto que está causando el problema. Verifica si el objeto es demasiado grande o complejo para ser serializado. Optimiza la serialización: Si es posible, optimiza la serialización del objeto utilizando técnicas como la serialización personalizada o el uso de bibliotecas de serialización más eficientes. Aumenta la memoria de pila: Aumenta la memoria de pila asignada a los trabajadores para evitar desbordamientos de pila. Puedes hacerlo configurando las siguientes propiedades de Spark:

    
    
    • -conf spark.executor.memoryOverhead=256
    • -conf spark.kryoserializer.buffer.max=256

    Solución adicional:

    Además de las sugerencias anteriores, también puedes probar las siguientes soluciones:

    Usa el formato Parquet: Intenta utilizar el formato Parquet en lugar de Avro, ya que es más eficiente para datos grandes y anidados. Reparte los datos: Divide los datos en particiones más pequeñas para evitar que un solo trabajador se quede sin memoria. Aumenta el número de trabajadores: Asigna más trabajadores al trabajo de Spark para distribuir la carga de procesamiento. Habilita la recolección de basura: Configura la recolección de basura en los trabajadores para liberar memoria y prevenir desbordamientos de pila. Puedes hacerlo agregando la siguiente propiedad a la configuración de Spark:

    
    
    • -conf spark.executor.extraJavaOptions=-XX:+UseG1GC

    Respondida el Dec 18, 2020 a las 13:53 - por Gemini

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