Preguntas con Tag: r
R es un entorno de software libre de código abierto para computación estadística, bioinformática, visualización " computación general. Por favor use ejemplos reproducibles mínimos otros pueden ...
Cómo pasar el parámetro a nuevo marco de datos para SQL UPDATE utilizando la piscina R
Estoy tratando de pasar dataframe a nuevo parámetro y luego UPDATE a SQL. Estoy atrapada en pasar el paramater
library(pool)
library(RMySQL)
library(DT)
library(DBI)
ui <- actionButt
r
parameter-passing
pool
3 años, 4 meses, 29 días
Cómo reestructurar columnas que algunos de ellos deben tener los mismos valores en R
Tengo una muestra como esta.
r
3 años, 4 meses, 29 días
Importancia variable para la regresión forestal aleatoria
Tengo problemas para entender el significado exacto de la característica puntajes de importancia en cuidado de la regresión RF. Como usted sabe hay muchas medidas de importancia potencial para RF.
r
random-forest
r-caret
3 años, 4 meses, 29 días
descarga desde github devuelve '404 no se encuentra' más el tamaño de descarga incorrecto
Estoy tratando de descargar un archivo .tif de github usando este código:
file1 <- "modis_mcd12q1_umd_2010.tif"
dir.create("data", showWarnings = FALSE)
if (!file.exists(file.path(
r
github
download
3 años, 4 meses, 29 días
¿Cómo trazar el exceso de retornos en ggplot2?
El código que uso ahora mismo:
Excesstesla.df %>%
ggplot(aes(x = Date, y = Excess.return.Tesla))+
geom_line()+
ggtitle("Excess Return Tesla")+
labs(x = "Date", y = "Excess")+
r
ggplot2
3 años, 4 meses, 29 días
Tratando de calcular el envejecimiento y escribirlo en una nueva columna añadida en sobresalir dinámicamente en R
Fun group_tenure funciona pero no puede escribir “0-1 días” etc en nueva columna junto con el valor filtrado. Hoy Nueva es la columna en sobrecel que tiene envejecimiento.
r
3 años, 4 meses, 29 días
Cómo trazar la visualización de los valores perdidos para los grandes datos en R?
Me gustaría dibujar un diagrama de valores perdidos para un gran dato (1000 variables), intenté vis_miss función como sigue
library(naniar)
vis_miss(predictors, warn_large_data=TRUE)
r
plot
missing-data
3 años, 5 meses, 0 días
seleccionar colores gradientes en parcela() en R
Hola Estoy tratando de conseguir una trama que parece la imagen adjunta sin embargo me gustaría cambiar los colores para que ellos formen un gradiente ( los tres niveles de las variables trazadas s
r
ggplot2
plot
colors
arguments
3 años, 5 meses, 0 días
¿Por qué se dice que mi relación de riesgo es 1 con intervalo de confianza NA?
Estoy tratando de calcular la relación de riesgo para la coinfección usando el código:
*NET_post4['VCandShig']<-NA
NET_post4$VCandShig <- ifelse(NET_post4$VC=="Negative"& !is.na(NET_
r
na
confidence-interval
risk-analysis
3 años, 5 meses, 0 días
Cómo agrupar por una columna y pivotar más ancho en R
Tengo un marco de datos que estoy tratando de agrupar por una columna y pivot_wider. Aquí está mi marco de datos
df = structure(list(Date = structure(c(1608238800, 1608238800, 1608238
r
dplyr
tidyverse
3 años, 4 meses, 29 días
¿Hay una función R para crear objetos repetidamente?
Tengo un marco de datos (aunque no creo que el tipo de objeto fuente que tengo asuntos) que tiene una lista de 51 genes que me gustaría obtener la información de la ruta para (utilizando rWikiPathw
r
loops
for-loop
object
3 años, 5 meses, 0 días
¿Cómo se eliminan completamente los espacios entre tiras facetas (para conectar un geom_rect 'background')?
Me gustaría crear un complot R con ggplot2 en los que hay antecedentes de figuras utilizando geom_rect y también facetting para crear etiquetas bonitas (creo
r
ggplot2
3 años, 5 meses, 0 días
Validación cruzada de la regresión de cresta MSE
Primero que nada, tengo que disculparme por mi pobre inglés. Segundo, el objetivo de este post es que quiero reproducir la trama del MSE de la regresión de la cresta con ggplot2 en lugar de la func
r
ggplot2
plot
regression
glmnet
3 años, 5 meses, 0 días
Cómo mostrar y eje en escala de troncos con sólo poderes de 10 utilizando parcela en R
Me gustaría hacer una trama en R (utilizando el parcela función) con escala de registro en el eje Y que muestra en el eje y sólo el poder de 10 en un estilo como 10, 100, 1000... ¿Es posib
r
plot
scale
axis
logarithm
3 años, 5 meses, 0 días
Cómo añadir hooks de git pre-commit para comprobar que README. Rmd e índice. ¿Rmd ha sido tejido?
Tengo un paquete R con un sitio de documentación de pkgdown. Quiero crear un gancho de git para que si intento comprometer y empujar cambios a cualquiera README.Rmd o index.Rmd</
r
githooks
r-package
pkgdown
r-usethis
3 años, 4 meses, 29 días
¿Cómo puedo guardar addDrawToolbar formas dibujadas en un mapa de Shiny R Leaflet para que pueda reimportarlos?
Necesito tomar las formas dibujadas en un R Leaflet Shiny app utilizando addDrawToolbar dentro leaflet.extras y guardarlos en un archivo que puede ser rei
r
shiny
leaflet
3 años, 5 meses, 0 días
emparejar un marco de datos y guardarlos en una lista
# Example data
dat <- matrix(runif(2*300), ncol = 2, nrow = 20)
group <- rep_len(LETTERS[1:3], 20)
df <- cbind.data.frame(dat, Group = group)
# Greate subset groups
n <- levels(as.factor(g
r
list
dataframe
subset
3 años, 5 meses, 0 días
Ponga 2 o más líneas en cada faceta usando facet_wrap [duplicar]
<
r
ggplot2
facet-wrap
3 años, 5 meses, 0 días
¿Cómo etiquetar las unidades de menor nivel dentro de una estructura de organización (representadas por varias columnas LEVEL_ID)?
Tengo un conjunto de datos que enumera diferentes sectores de un gobierno a varios niveles del subsector. Se ve así:
LEVEL1ID LEVEL2ID LEVEL3ID LEVEL4ID LEVEL5ID YEAR DESC
r
data-cleaning
3 años, 4 meses, 29 días
Cómo eliminar filas de un marco de datos basado en una condición de grupo, sin perder algunas columnas [duplicar]
<
r
dataframe
subset
3 años, 4 meses, 28 días
¿Cómo mover las dos filas a la parte superior del marco de datos en una lista en R?
Hay una lista de marcos de datos que cada marco de datos tiene diferentes filas y columnas. El fondo de cada marco de datos es el total y porcentaje de filas. Quiero mover la fila porcentual a la p
r
list
row
3 años, 5 meses, 0 días
`group_by` y mantener los niveles de agrupación como el nombre del marco de datos anidado
Esta pregunta está relacionada e inspirada en no puede utilizar emmeans dentro del mapa
Estoy haciendo v
r
dplyr
purrr
3 años, 5 meses, 0 días
Factor Columnas de conversión a números en R DataFrame después de mutar
Mi código R funcionaba perfectamente bien en R Studio pero cuando pegaba el mismo código en Kaggle Notebook comenzó a dar errores. Convirtió mis factores a los números cuando se aplica si se usa co
r
dplyr
r-markdown
tidyverse
kaggle
3 años, 4 meses, 29 días
¿Cómo cambiar algunos nombres de muestra en símbolos como puntos o estrellas en PCA en R?
Hay 2 categorías de 10 datos (SNP1-SNP10), espero usar símbolos para separarlos, pero cómo escribir códigos en R. Mis códigos están abajo:
data=read.table(file= "snp.txt",header= T,se
r
symbols
pca
sample
3 años, 4 meses, 29 días
Ejecute un bucle donde se simulan los datos y luego se promedio dentro
Me gustaría ejecutar el código debajo de 100 veces:
require(phytools)
require(RRphylo)
linbm <- rowMeans(fastBM(lattree, a = spreadlind[1,1], bounds=c(min(spreadlind),max(spreadlind)
r
loops
for-loop
simulation
phylogeny
3 años, 4 meses, 27 días
Calcular relación cada dos filas con partidos de cadena parcial
Estoy tratando de calcular una relación usando esta fórmula: log2(_5p/3p).
Tengo un marco de datos en R y las entradas tienen el mismo nombre excepto su última parte que será _3p
r
dataframe
dplyr
3 años, 4 meses, 29 días
read.delim no tal archivo o directorio en R
Tengo una lista de archivos de list.files() en el directorio actual tales que:
setwd("~/Data/LUSC/unc.edu_LUSC.IlluminaHiSeq_RNASeq.Level_3.1.2.0")
exprs_files <- list.fi
r
3 años, 4 meses, 29 días
Tibbles concatenados con diferentes columnas
Quiero concatenar tibbles,
hay pocas columnas comunes
pocas columnas con el mismo nombre pero diferentes valores
una columna diferente
He creado un ejemplo a
r
tidyverse
3 años, 4 meses, 29 días
Cómo proceder con estadísticas descriptivas (mediana, IQR, frecuencias, proporciones, etc) después de múltiples imputaciones utilizando MICE
He estado realizando múltiples imputaciones usando el paquete de ratones (van Buuren) en R, con m = 50 (50 datasets de imputación) y 20 iteraciones para aproximadamente 9 variables con datos perdid
r
imputation
r-mice
3 años, 4 meses, 27 días
Cómo puedo obtener R para contar el número de observaciones en un conjunto de datos que se encuentran bajo una categoría definida en otro conjunto de datos [cerrado]
<
r
excel
3 años, 4 meses, 27 días
() función en r no es encontrar mis columnas cuando existen
Tengo un marco de datos que detalla el recuento de ambos nombres que fueron más largos de 5 letras y nombres que fueron más cortos que 5 cartas de la biblioteca babynames, que tengo de
r
dataframe
3 años, 5 meses, 0 días
Crear nueva columna con valores indexados en otra tabla
Tengo dos mesas:
Cuadro 1
Var1 Var2
01-01 dhold_1
01-01 dhold_2
01-01 dhold_3
02-01 dhold_1
02-01 dhold_2
03-01 dhold_3
Cuadro 2
md dh
r
indexing
lookup
3 años, 4 meses, 27 días
Extraer texto en R entre palabras clave
Tengo texto extraído de PDF que parece algo así:
String<-"A recorded vote was taken. In favour: Vanuatu, Venezuela (Bolivarian Republic of), Viet Nam, Yemen, Zambia, Zimbabwe Against:
r
regex
stringr
3 años, 4 meses, 27 días
¿Cómo arreglar un bucle para escribir varios archivos FASTA de DNAStringSet en R?
Tengo este DNAStringSet (genomes) y necesito poner cada genoma como un archivo FASTA individual en un directorio, pero que siguen siendo StringSets de longitud=1. El nombre de cada archivo está con
r
loops
fasta
dna-sequence
writefile
3 años, 4 meses, 29 días
No se puede conseguir ggraph para mostrar etiquetas para un dendrogram
Uso ggraph para visualizar los resultados de un análisis de racimo. Pero no puedo conseguir ggraph para mostrar etiquetas. Traté de agregarlos como nombres de fila a los datos, y traté de agregarlo
r
label
data-science
dendrogram
ggraph
3 años, 4 meses, 29 días
¿Cómo enderezar el mapa de ggplot2 con datos de raster?
Al trazar mi mapa de los datos de canopy árbol NLCD (un mapa), el mapa no está recto ni alineado con la frontera del mapa. El skew parece ocurrir al usar la función de proyectoRaster. ¿Hay una mane
r
ggplot2
raster
map-projections
3 años, 4 meses, 29 días
Tabla de lectura en idioma R
Estoy empezando a programar en lenguaje R y estoy tratando de leer datos de un archivo .txt. Tengo los datos escritos en líneas (un valor en cada uno), y trato de asignarlo a un vector x de la sigu
r
list
3 años, 4 meses, 29 días
Cómo construir un índice único de orden inverso por grupo en R
Mis datos parecen así.
#My data
df <- structure(list(G1 = c("k", "i", "g", "r", "d", "l", "q", "q",
"g", "g", "u", "c", "q", "m", "x"), Val = c(-0.451975472583735,
-0.19872979175927
r
dplyr
3 años, 4 meses, 28 días
Nombre del atributo HTML rvest
Estoy tratando de raspar un sitio web de correos de trabajo con rvest (
r
web-scraping
rvest
3 años, 5 meses, 0 días
¿Cómo conseguir todos los puntos en boxplot usando ggplot?
Me gustaría mostrar un folleto con un punto para cada uno de mis datos.
Aquí está mi muestra de mis datos:
value value1 value2 value3 value4 value5 value6 value7 va
r
ggplot2
3 años, 4 meses, 29 días
Múltiples fusiones usando base R
Usando la función "merge" en (base) R, he descubierto cómo hacer unidas en una sola columna ... si esa columna tiene el mismo nombre en ambas tablas: (en este ejemplo, hago una unión izquierda)
r
join
merge
data-manipulation
3 años, 4 meses, 29 días
Ioslide aparece negro
Esta es una pregunta general. Si corres un pedazo actual (flecha verde a la derecha) y produce el resultado deseado pero sin embargo no teje, ¿qué causa eso? Cuando tejer, la sexta diapositiva en e
r
ioslides
3 años, 4 meses, 29 días
R - resumir /colapsing observaciones seleccionando el valor máximo de una estreca
Estoy trabajando en la siguiente idea. Espero que puedas ayudar.
UPDATED
He añadido un tercer tema que altera el problema
DATOS
r
dplyr
3 años, 5 meses, 1 días
cómo combinar dos datos. marco y marca encontrado o no
Tengo dos datos.frame, df1 y df2 que parecen:
df1:
r
merge
3 años, 5 meses, 0 días
scala combina colecciones como colecciones 1d
Me gustaría tener funciones como el lenguaje R c función :
#R
print(c(c(1,2,3),2,3,c(1,2)))
> c(1,2,3,2,3,1,2)
mi solución es
trait SeqMagn
r
scala
collections
3 años, 4 meses, 28 días
R: Número de observaciones dentro de un grupo
Usando el lenguaje de programación R, estoy tratando de seguir este tutorial aquí: Nú
r
dplyr
group-by
count
aggregate
3 años, 4 meses, 28 días
Reemplazar espacios por pestaña
Hice un análisis en R con el paquete 'indicspecies',
indval.ch <- multipatt(species.indval, samples.indval, duleg = FALSE)
summary(indval.ch)
por la salida es así
r
3 años, 4 meses, 27 días
¿Cómo contar observaciones con cierto valor en un grupo condicionalmente?
Estoy trabajando con el siguiente marco de datos:
Year Month Day X Y Color
2018 January 1 4.5 6 Red
2018 January 4 3.2 8.1 Red
2018
r
dataframe
3 años, 4 meses, 27 días
crear lista de caracteres en R tibble
Tengo un tibble con una columna de carácter. El personaje en cada fila es un conjunto de palabras como esta: "tipo:mitipo,variable: mivariable,variable:miotrovariable:asubvariable de este otro inva
r
tidyverse
tibble
3 años, 4 meses, 27 días